1、北醫三院站： 乘坐331路、94路、606路、484路公交，在北醫三院站下車即到，醫院位于花園北路北側;

2、北京航空航天大學站：乘坐375路、386路、438路、478路、603路、632路、686路、693路等公交

· 在北京航空航天大學站(馬路東側站)下車,向南步行100米，到達花園北路口后，向東500米，即可到達醫院南門。

· 在北京航空航天大學站(學院路西側站)下車，向南步行約150米，到達花園北路十字路口后，過馬路，向東步行380米，即可到達醫院南門。

3、塔院小區南門站：乘坐21路、579路、601路、653路、658路、夜9路等公交

· 在塔院小區南門站(北土城西路北側)下車，沿北土城西路輔路向西行走80米，右轉進入塔院西街，行走540米，到達花園北路，過馬路向東行走100米，即可到達醫院南門。

· 在塔院小區南門站(北土城西路南側)下車，沿北土城西路輔路向東直行60米，上天橋過馬路，再沿北土城西路輔路向東走120米，左轉進入塔院東街，步行700米左右到達花園北路，過馬路，向西行走60米，即可到達醫院南門。

乘坐10號線，在西土城站B口或牡丹園站A口下

1、在西土城站B口出站，向正北方向出發，沿西土城路輔路直行200米，再沿學院路輔路直行330米，進入花園北路，向東直行380米，過馬路，向東步行50米，即可到達醫院南門。 (步行約14分鐘，900米)

2、在牡丹園站A口出站，向正西方向出發，沿北土城西路走490米，右轉進入塔院東街，沿塔院東街向北步行700米左右至花園北路，過馬路向西行走100米，即可達到醫院南門。(步行約21分鐘，1.4公里)

導航“北京大學第三醫院”(北京市海淀區花園北路49號)即可